Die Brötchen in kleine Würfel schneiden und in eine Schüssel geben.
Butter in eine Pfanne geben und schmelzen lassen. Die Zwiebel schälen und fein würfeln. Zwiebelwürfel in der geschmolzenen Butter glasig dünsten.
Den Rote Beete Saft in einen Topf geben und erwärmen. Anschließend zusammen mit den Zwiebeln über die Brötchenwürfel gießen und 5 Minuten stehen lassen. Die Masse gut durchkneten. Ei, Quark und Parmesan hinzufügen und mit Salz und Pfeffer abschmecken. Alles zu einer geschmeidigen Knödelmasse vermischen und mit feuchten Händen 6 Knödel formen.
Die Knödel entweder 20 Minuten dampfgaren oder in leicht siedendem Wasser 15-20 Minuten ziehen lassen bis sie oben schwimmen.
In der Zwischenzeit die Milch mit dem Thymian aufkochen lassen und vom Herd nehmen. 10 Minuten ziehen lassen. Den Thymian herausnehmen, den Frischkäse einrühren und mit Salz und Pfeffer würzen.
Die Milch nochmals erhitzen (nicht mehr kochen) und mit einem Stabmixer aufschäumen.
Die Knödel auf einem Teller anrichten und mit dem Ziegenkäseschaum servieren.